ピンが海賊(かいぞく)のおきてを破った罪に問われたため、ポーはフォロウザンが取り仕切る裁判で父を弁護。ところが、ピンには息子に明かしていない秘密があり...。

フォロウザンが作り出したルールが唯一(ゆいいつ)のルールとなる"運命を決めるトーナメント3回戦"。ポーと仲間たちは自由を求めて、この勝負にいどむ。

ドレーク卿(きょう)の騎士(きし)たちに追われながら、ピンは仲間たちを引き連れ、天山の武器の箱を回収しにフォロウザンの秘密のかくし場所へと向かう。

イングランドにもどってきたブレードは、自らのやり方をつらぬき、アルフィの最後の日々をたどる。そんな中、イングランドのクイーンと対戦できるチェス大会にしのびこむことに。

ブレードは、アルフィが15年前に出会った湿地(しっち)のモンスターとの戦いをちかう。そして、見つけたものが何であれ、兄がいなくなった答えがあるはずだと感じる。

アルフィの足あとをたどって、古代の都市へとやってきた龍(りゅう)の戦士たち。ブレードにとって最も居心地の悪い場所である母の家で、アルフィの日記を探す。

かくされたシンボルを見つけるため、龍の戦士たちは町の道化師と力を合わせる。一方、ピンは思いがけない協力者からの助けを借りつつ、武器の箱を守ることに。

龍の戦士たちと新たなメンバーがきみょうで神秘的な空間を進んでいく。そんな中、ヴェルーカは自身の祖先についておどろくべき事実を知る。

二手に分かれることになった一行。ブレードとルシンダはドレーク卿からアルフィの剣(けん)を取りもどすために家へ帰り、残りのメンバーは武器を受け取るために港でピンと落ち合う。

クイーンがドレーク卿のミッションを中止。騎士道に泥(どろ)をぬった罪として、ドレーク卿はブレードをつかまえ、死をもってつぐなわせようと心に決める。

天山の武器の力を使って古代のおそろしい軍団を解き放ち、世界を破壊(はかい)しようと試みるヴェルーカ。ポーたちはその前に武器をこわすべく、鍛冶場(かじば)へと急ぐ。

天山の武器が新たな支配者の手にわたってしまう。やむを得ず、龍の戦士たちは解散してそれぞれの故郷へもどるが、世界はすっかり荒(あ)れ果てていて...。

弱気になり、ぼうけんへの熱意を失ってしまったポー。ブレードはやる気を取りもどさせようと、アイデアマンのヒゲをつけて特別なミッションを計画する。

アクナを連れ帰るため、ポーがティカールに向かう一方、ブレードはルクミニを見つけにライプールへと旅立つ。だが、久しぶりに会った仲間たちは再結集をためらっているよう。

龍の戦士たちが再び結集し、武器を取りもどすための最後の希望は思いがけない人物にたくされる。そして、一同は魔法(まほう)使いの島へと向かう。

力を解き放つためには、まず自身の心の中を見つめる必要があるとクラウスに教えるポー。他のメンバーが食料を探すなか、コリンに好かれていると知ったブレードは、彼(かれ)をさけるように。

クラウスが自身の力を古代のマスターたちとつなげられるよう、龍の戦士はロストシティへ。そこで、マスターたちは一行に重要なメッセージを告げる。

中国とイングランドのにせの戦争によって、古代の軍団が足止めされるなか、龍の戦士たちは天山の武器の1つをうばい返そうと試みる。

四大元素が乱れパンゲアがくずれていくなか、最後の希望をたくされたブレード。果たして、全能の武器マスターと戦い、世界を救うことはできるのか。