ＮＣＩＳシドニーは逃亡中の殺し屋を捕まえようと必死に捜査を行う。そんな中、特別捜査官のデショーン･ジャクソンがボスに任命され、就任初日は、さらに混乱が生じる。

少女が港に浮かぶ休隊中のアメリカ海軍将校の遺体を発見。デショーンとエヴィーは調査のため、18世紀の帆船で行われる海賊をテーマとした結婚式へ潜入する。

長い間、行方不明になっていたアメリカ海軍兵の遺体がコンクリートの中から発見され、ロイの旧友が捜査に協力する。

アメリカ海軍サイバーセキュリティ担当者の車が爆発。彼女の10代の娘が運転の練習をしようとした矢先だった。これによりＮＣＩＳシドニーはネット上に渦巻く陰謀論の世界に巻き込まれる。

１等兵曹が無残に殺害され凍った状態で発見される。ＮＣＩＳシドニーは、密売や性目的の人身売買が行われている裏社会の存在を知る。

元アメリカ海軍特殊部隊隊員の自殺が疑われたことから、ＮＣＩＳシドニーは保養所へ赴き、彼の元同僚たちを調査する。その結果、彼らは死の危険にさらされることとなる。

アメリカ海軍合唱隊の１人が死亡し、ＮＣＩＳシドニーが事件を捜査。ポップスターに熱狂的なファン、耳に残る音楽の世界に引き込まれ、音楽業界がいかに命がけであるかを知ることになる。

失血死した船員が発見され、ＮＣＩＳシドニーは現代の吸血鬼、家族間の確執、特注ウォッカ、血を好み夜に活動する女当主の世界に足を踏み入れる。

オーストラリア北部でアメリカとオーストラリアの軍事演習中に事件が発生。ＮＣＩＳシドニーはワニや害虫、強烈な暑さと闘いながら事件を捜査。やがて事件は大きな展開を見せ...

スティンガー・ミサイルと殺人犯が行方をくらます中、ダーウィンでの第二次世界大戦の追悼式典が近づく。ＮＣＩＳシドニーは甚大な被害をもたらす攻撃を阻止するため奔走する。